หน่วยงานภายใน
สำนักงานอธิการบดี
- กองบริหารศูนย์ท่าพระจันทร์
- กองทรัพยากรมนุษย์
- กองกิจการนักศึกษา
- กองคลัง
- กองบริหารงานวิชาการ
- กองแผนงาน
- กองบริหารศูนย์รังสิต
- กองพัฒนาคุณภาพ
- กองบริหารศูนย์ลำปาง
- กองวิเทศสัมพันธ์
- กองบริหารการวิจัย
- กองนิติการ
- สนง.ตรวจสอบภายใน
- สภามหาวิทยาลัย
- กองบริหารการคลังกลุ่มภารกิจ
- กองบริหารศูนย์พัทยา
สำนัก/สถาบัน/ศูนย์วิชาการ/วิจัย
- หอสมุดแห่งมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์
- สถาบันเสริมศึกษาและทรัพยากรมนุษย์
- สำนักงานทะเบียนนักศึกษา
- สถาบันไทยคดีศึกษา
- สถาบันเอเชียตะวันออกศึกษา
- สถาบันภาษา
- สำนักงานศูนย์วิจัยและให้คำปรึกษาแห่ง มธ.
- สำนักงานศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศและการสื่อสาร
- สถาบันสัญญาธรรมศักดิ์เพื่อประชาธิปไตย
- สถาบันศึกษาความร่วมมือระหว่างประเทศ แห่งมธ.
- สถาบันอาณาบริเวณศึกษา
- ศูนย์ศึกษารัสเซียและเครือรัฐเอกราช
- ศูนย์จัดการศึกษาและฝึกอบรมด้านกฎหมาย (LeTec)
- สำนักงานวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีชั้นสูง
- ศูนย์ทรัพย์สินทางปัญญาและบ่มเพาะวิสาหกิจ
- ศูนย์เครื่องมือวิทยาศาสตร์เพื่อการวิจัยขั้นสูง
- ศูนย์วิจัยค้นคว้าและพัฒนายา
- ศูนย์สัตว์ทดลอง
- ศูนย์ประสานราชการใสสะอาด
โครงการ
- โครงการสตรีและเยาวชนศึกษา
- โครงการหอจดหมายเหตุธรรมศาสตร์
สภา
- สภามหาวิทยาลัย
- สภาอาจารย์
- สภาพนักงานมหาวิทยาลัย
หน่วยงานบริการ
- โรงพยาบาลธรรมศาสตร์เฉลิมพระเกียรติ
- สำนักงานบริหารทรัพย์สินและกีฬา
- ศูนย์ประชุมธรรมศาสตร์ รังสิต
หน่วยงานอื่น ๆ
- สำนักงานธรรมศาสตร์สัมพันธ์
- สหกรณ์ออมทรัพย์
- สำนักพิมพ์
- โรงพิมพ์
- ศูนย์หนังสือ
- ศูนย์พัฒนาเด็กปฐมวัย
- โรงเรียนอนุบาลแห่งมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์
- โรงเรียนประถมศึกษาธรรมศาสตร์
- โรงเรียนธรรมศาสตร์คลองหลวงวิทยาคม
- โรงเรียนสาธิตแห่งมหาวิทยาลัยธรรมศาสตร์